Năm mươi tư năm, kể từ khi thành lập đến nay (1971-2025), Tổng Công ty Xây dựng Nông nghiệp và phát triển Nông thôn Thanh hoá đã không ngừng phát triển và lớn mạnh. Tiền thân là Công ty Xây dựng thuỷ lợi -Thuỷ điện Thanh Hoá; Năm 1978 được tách ra thành 2 Công ty: Công ty xây dựng thuỷ lợi - Thuỷ điện Thanh Hoá làm công tác xây dựng thuỷ lợi trong nước và Công ty xây dựng thuỷ lợi thuỷ điện C chuyên làm công tác xây dựng thuỷ lợi bên nước bạn Lào. Năm 1990 Công ty xây dựng thuỷ lợi - thuỷ điện Thanh Hoá được đổi tên thành Công ty xây dựng thuỷ lợi 1 ; Công ty xây dựng thuỷ lợi - Thuỷ điện C đổi tên thành Công ty xây dựng thuỷ lợi 2. Năm 1997 Uỷ ban nhân tỉnh Thanh Hoá có quyết định hợp nhất 3 đơn vị thành một đó là: Công ty xây dựng thuỷ lợi 1, Công ty xây dựng thuỷ lợi 2, Xí nghiệp giao thông thuỷ lợi Thọ Xuân thành Công ty xây dựng nông nghiệp và phát triển nông thôn Thanh Hoá. Hiện nay với đội ngũ cán bộ được đào tạo bài bản, giàu kinh nghiệm, cùng hệ thống máy móc thiết bị hiện đại, Tổng công ty đã và đang tham gia thi công nhiều công trình trọng điểm trong lĩnh vực nông nghiệp và phát triển nông thôn, góp phần vào sự nghiệp xây dựng và phát triển kinh tế - xã hội của đất nước.